Suite au départ de Roberto Orci, la Paramount a été contrainte de dénicher au plus vite un nouveau réalisateur pour superviser le troisième volet de la saga Star Trek rebootée en 2009 par J.J. Abrams. C'est désormais chose faite puisqu'après avoir songé à des cinéastes comme Rupert Wyatt (La Planète des singes : Les Origines), Morten Tyldum (Imitation Game), Daniel Espinosa (Sécurité rapprochée) et Duncan Jones (Source Code), le studio a jeté son dévolu sur Justin Lin, réalisateur des chapitres 3, 4, 5 et 6 de la franchise Fast & Furious. Une nouvelle qui ne fait pas l’unanimité sur internet, mais qui semble logique du point de vue des producteurs, les films de Lin ayant prouvé que celui-ci savait gérer l’action et les effets numériques. Pour rappel, le scénario  est écrit par Orci, John D. Payne et Patrick McKay.